Nuestro órgano de gobierno es la Asamblea General que está constituida por cada uno de los representantes legales de las asociaciones de padres integradas en la Federación como miembros de pleno derecho.

La Junta Directiva es el órgano permanente de gestión entre cada una de las asambleas generales. Actualmente está compuesta por las siguientes personas:

Presidente	Alfonso Aparicio Basauri
Vicepresidente	José Javier Solabre Heras
Secretaria	Mª de las Mercedes Fudio Muñoz
Tesorero (Tudela)	Mª Isabel Lumbreras Dominguez
Vocal	José Miguel Garbayo Villanueva
Vocal	José Luis Frachet Apezetxea
Vocal por Tudela	Maribel Antón Irujo
Vocal	Jesús Mª Martínez
Vocal	Nicolás Iribas Sanchez de Boado
Vocal	Eva Mª Ruiz Navarro
Vocal	Mª Jesús Alonso Burguete

El Consejo Federal es un órgano intermedio entre la Junta Directiva de la Federación y la de la Asociación correspondiente. Tiene carácter consultivo y está integrado por un representante cualesquiera de la Asociación, no necesariamente de su Junta Directiva. Pretende, de una manera más ágil e informal, hacer de nexo de unión entre la Federación y los padres vinculados a ella. Por otra parte, se pretende que el conocimiento sobre la gestión de la Federación pueda llegar a más padres, procurando un incremento de la participación.